撒哈拉以南非洲地区的商业航空运输每年以两位数的速度增长，各方面也在发生巨大的变化，这又对安全提出了新的挑战。最近，那些使用俄制飞机的航空公司创造了最差的安全记录，应该被禁飞。但是那些使用西方制造飞机的非洲航空公司在过去的10年当中，平均每百万次飞行中也有两次重大事故，远远超过了世界上其它大型航空公司。

　　有些非洲航空公司已经或将要达到国际安全标准。例如埃及航空就已经注册通过了国际航协（IATA）的运营安全审计（IOSA）程序，南非航空公司和肯尼亚航空公司马上也将通过该项审计。但是在强制实施统一标准之前，乘客和航空公司的合作伙伴还是对他们持不信任的态度。

　　WAKE质量认证的主席NicPackwood说：“所有的非洲航空公司都被认为是‘一丘之貉’，原因就是由于它们是非洲的航空公司。尽管它们当中有很多是安全的，但它们仍旧没有多少业务。”

　　许多非洲国家都很贫穷，有些国家还在遭受着政局动荡、内战的煎熬。为此，国际航协(IATA)推行了一个特别计划——安全合作(PFS)，将IOSA应用到撒哈拉以南的非洲地区，厄立特里亚和苏丹等，来改善非洲航空运输的安全状况。